海洋研究院成立于2018年6月，设立了海洋智能装备开发、海洋生物资源开发、海岸带生态修复3个研究方向。

先后完成并验收通过了《福建省海岸带生态修复技术创新平台》《渔业资源监测机器人系统开发及在海洋牧场管理中的应用》2个重大项目，目前正主持《小球藻胞外聚合物对纺织类微塑料PAN的响应及其机理》和《基于AI的海洋水下声光联合鱼类识别方法研究及软件系统研发》等福建省自然科学基金项目。储备项目10余项。促进海洋资源与环境专业崛起，更好服务福建省现代渔业千亿级产业集群高质量发展。